Geboren in het nietige Eexterveen, in Drenthe, en de gehele jeugdopleiding van FC Groningen doorlopen is Jan Hoekstra nu de nieuwe aanwinst van FC Emmen. Een echte Drent in de gelederen bij de Emmenaren nu.
Het heeft even geduurd voordat hij tekende want hij vertelde ons twee weken terug al tijdens de eerste training van FC Groningen dat hij naar FC Emmen zou gaan maar nu maken beide clubs de overgang dus bekend.
Jan Hoekstra kwam via de jeugd van VV Gieterveen bij FC Groningen, waar hij in 2017 bij de eerste selectie kwam. Zijn debuut in het betaalde voetbal maakte hij op 30 augustus 2020 in het shirt van Roda JC, dat hem huurde van de Groningers. Bij Roda JC speelde hij dertig wedstrijden, dat seizoen schopten de Koempels het tot de tweede ronde van de play-offs om promotie naar de Eredivisie.